期刊简介
《中国海洋药物》杂志是由中国科协主管、中国药学会主办、国内外公开发行的全国性科技核心期刊。《中国海洋药物》杂志是在国海洋药物研究创办最早的学术期刊，自1982年创刊以来一直被国家科技部列入中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)，并被国外主要检索期刊美国化学文摘(CA)收录。2002年又作为核心期刊被联合国水科学和渔业文摘(ASFA)收录等。本刊不仅在国内有相当的学术影响，在国外也有较高的知名度。
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首页>中国海洋药物杂志
- 杂志名称：中国海洋药物杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中国药学会
- 国际刊号：1002-3461
- 国内刊号：37-1155/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：CA收录期刊期刊收录：国家图书馆馆藏, 剑桥科学文摘, CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 上海图书馆馆藏, 万方收录(中), 知网收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), CA 化学文摘(美)
基于元基因组的南海海绵Theonella swinhoei共生微生物次级代谢潜力研究
柴光俊；李金龙；冯国芳；刘放；孙伟；张风丽；李志勇
关键词：Theonella swinhoei, 元基因组, 海绵共生微生物, 次级代谢潜力
摘要：目的 揭示中国南海海绵Theonella swinhoei共生微生物次级代谢潜力.方法 用Illumina Hiseq 2000测序仪对T.swinhoei元基因组DNA进行测序,用MG-RAST平台对共生微生物种群结构和功能进行分析,并比较此海绵与其他海绵的次级代谢差异.用fragment recruitment方法评估T.swinhoei元基因组中具有代表性的微生物在此种海绵和其他生境中的丰度.用antiSMASH预测T.swinhoei元基因组中次级代谢产物生物合成基因簇,并通过序列比对分析其来源.结果 T.swinhoei共生微生物主要包括Proteobacteria (30.5％)、Actinobacteria(6.2％)、Poribacteria(3.6％)、Firmicutes(3.5％)、Chloroflexi(2.6％)和Cyanobacteria(2.1％).Candidatus Entotheonella sp.TSY1和Candidatus Entotheonella sp.TSY2在T.swinhoei中的丰度比其他生境高很多.T.swinhoei共生微生物中聚酮合酶模块和相关蛋白(COG3321)以及非核糖体肽合成酶模块和相关蛋白(COG1020)基因的比例比其他海绵共生微生物中的比例高.次级代谢产物生物合成基因簇除来自Candidatus Entotheonella外,还有许多来自未知的共生细菌和可能的蓝细菌.结论 中国南海海绵T.swinhoei共生微生物具有很强的次级代谢潜力,为研究海绵天然产物微生物来源提供了依据,同时为进一步开发利用T.swinhoei共生微生物资源提供了基础.
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